La tesis de master es un trabajo de investigación original realizado por el alumno bajo la tutela de un director. La investigación tiene que hacerse necesariamente en uno de los centros aprobados por la Comisión Académica del máster, y con un director aprobado por esta Comisión. Excepcionalmente, los alumnos pueden proponer, mediante un escrito al director del master, un director y un laboratorio distinto, pero este laboratorio tiene que ser aprobado por la Comisión Académica del master. Tanto el laboratorio como el director propuesto tienen que cumplir el requisito de tener un nivel científico internacional. La evaluación de la Tesis se efectuará mediante su defensa en acto público, ante un tribunal formado por tres miembros que serán designados por la Comisión Académica del Máster.